SynthID Bio 將浮水印導入蛋白質,追蹤 AI 設計來源

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AI 摘要

  • SynthID Bio 可在 AI 設計的蛋白質中嵌入浮水印。
  • 實驗顯示浮水印不影響蛋白質功能。
  • Google 已開放程式碼與部分研究資料。

SynthID Bio 是 Google DeepMind 將 SynthID 浮水印技術延伸至合成生物學的工具,可在 AI 設計的蛋白質序列及 3D 結構中嵌入不易察覺的標記,協助辨識和追蹤其來源。Google 表示,實驗顯示加入浮水印後,蛋白質仍能維持原有生物功能。

依 AI 任務在序列或結構中嵌入標記

SynthID Bio 會依 AI 模型的用途採取不同方式。用於設計新蛋白質時,系統會在模型選擇胺基酸序列的過程中加入可辨識訊號;用於預測蛋白質結構時,則會微幅調整預測出的原子座標,在 3D 結構中留下浮水印。

用途浮水印方式來源確認的結果
設計新蛋白質在 AI 選擇胺基酸序列時嵌入可辨識訊號加入浮水印的蛋白質結合劑仍能與目標蛋白質結合,表現與未加浮水印的版本相當
預測蛋白質結構微幅調整預測出的原子座標浮水印偵測率接近 100%;即使資料受到雜訊干擾或座標輕微修改,仍可辨識

蛋白質結合測試顯示功能維持

Google DeepMind 利用 AI 設計可分別與 VEGF-A、SARS-CoV-2 棘蛋白 RBD 及 PD-L1 結合的蛋白質結合劑,並進行合成測試。結果顯示,加入浮水印的結合劑仍可正常與目標蛋白質結合,表現與未加入浮水印的版本相當。

整合 AlphaFold 3,並拓展至基因體模型

針對 AI 預測的蛋白質 3D 結構,Google 修改 AlphaFold 3,讓模型在預測時細微調整原子座標,以嵌入浮水印。Google 表示,這些調整不會降低模型的預測準確度,且浮水印偵測率接近 100%。

Google DeepMind 也與史丹佛大學 Hie 實驗室及 Arc Institute 合作,將 SynthID Bio 整合至基因體模型 Evo 2,並成功為 Evo 2 設計的噬菌體基因組加入浮水印。初步實驗顯示,這些噬菌體仍具功能。

協助檢視公共生物資料庫

SynthID Bio 可用於 Protein Data Bank、UniProt 及 GenBank 等公共生物資料庫,協助辨識 AI 生成資料、確認合成資料是否正確標示來源,或將資料標記以供進一步審查。這項工具著眼於 AI 生成生物資料的來源追蹤與生物安全判斷。

研究資料與程式碼開放

Google 已透過 Nature 發表 SynthID Bio 研究論文,並在 GitHub 開源程式碼及體外實驗資料,也開放下載 SynthID Bio-structure 模型權重,供研究社群進一步驗證與研究。

Reference Link : ithome.com.tw

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